李朝军教授在利用水等绿色溶剂实现传统的化学反应，最大限度地提高原子利用率，以及可再生生物质资源的高效转化与利用等方面，进行了一系列开创性的研究工作，目前已发表研究论文280多篇，论文被同行他引总数超过11800次，5项发明专利已获得授权和应用。2005年至今，李朝军教授担任国际著名期刊Green Chemistry副主编，并被聘为美国国会绿色化学听证会成员。